[Doktoranci-misdomp] Seminarium MISDoMP - 17.12.2020 g. 17.00

Pią, 18 Gru 2020, 19:05:11 CET

Dobry wieczór,

Obiecane linki dotyczące AlphaFold2:

Wyniki, które tak zelektryzowały świat -
https://predictioncenter.org/casp14/zscores_final.cgi
Abstrakt z CASP14 - tutaj mozna znaleźć zarys metodologii
https://predictioncenter.org/casp14/doc/CASP14_Abstracts.pdf
Post na blogu o obecnej sytuacji i dalszych wyzwaniach w nauce
https://aloshbau.medium.com/decades-of-turbo-charged-biotech-advances-could-follow-deepminds-game-changing-alphafold-algorithm-34f54686e702
Nie może zabraknąć Nature  -
https://www.nature.com/articles/d41586-020-03348-4

Na oficjalne publikacje niestety musimy jeszcze trochę poczekać.

Do zobaczenia na styczniowym seminarium!

Joanna Macnar

wt., 15 gru 2020 o 13:38 Anna Ajduk <aajduk w biol.uw.edu.pl> napisał(a):

> Szanowni Państwo,
>
> Mały update:
> Tytuł czwartkowej prezentacji: Czy jakość jeszcze ma znaczenie? *Data
> mining* w biologii strukturalnej na przykładzie modeli makromolekuł
> Abstrakt: Informacje strukturalne o kompleksach ligand-makrocząsteczka
> mają kluczowe znaczenie dla nauk biomedycznych, zwłaszcza dla odkrywania
> leków w oparciu o strukturę, i bioinformatyki
> strukturalnej. Większość danych doświadczalnych na temat białek
> skompleksowanych z ligandami pochodzi z krystalografii rentgenowskiej.
> Podczas seminarium wspólnie przyjrzymy się wpłowi nowych
> żródeł promieniowana na jakość deponowanych w PDB struktur, a
> także sprawdzimy jak czas pandemii wpłynął na otrzymywane modele białek.
> Do zobaczenia w czwartek,
> AA
>
> On Sun, 13 Dec 2020 20:18:45 +0100, Anna Ajduk wrote:
>
> Szanowni Państwo,
>
> Przypominam o czwartkowym seminarium na Zoomie.
>
> Link:
>
> Join Zoom Meeting
> https://us02web.zoom.us/j/81886781896
>
> Meeting ID: 818 8678 1896
>
> Prelegent: *Joanna Macnar*
>
> Tytuł i abstrakt: TBA - *Pani Joanno, proszę o ich przesłanie jak
> najszybciej, najlepiej do jutrzejszego wieczora.*
>
> Do zobaczenia,
>
> Anna Ajduk
>
>
>
>
>
>
>
> On Tue, 17 Nov 2020 17:41:52 +0100, Anna Ajduk wrote:
>
> Szanowni Państwo,
>
> Przypominam o czwartkowym seminarium na Zoomie.
>
> Link:
> https://us02web.zoom.us/j/84689357887?pwd=Vk1PVTVTLytZQTI2MTdta0UxUzVhZz09
>
> Prelegent: Michał Ciach
>
> Tytuł: Zastosowanie teorii optymalnego transportu do porównywania widm
> masowych
>
> Abstrakt: Algorytmy stosowane do przetwarzania i analizy widm masowych
> często opierają się na określaniu podobieństwa pomiędzy dwoma widmami. Na
> ogół robi się to poprzez porównanie intensywności sygnałów odpowiadających
> tym samym masom. Moje badania dotyczą porównywania widm w taki sposób, aby
> uwzględnić drobne różnice w położeniach sygnałów wynikające z
> niedokładności pomiarowych. Zaproponowane podejście opiera się na teorii
> optymalnego transportu: dwa widma są tym bardziej podobne, im mniej
> zniekształceń należy wprowadzić w jedno z nich, aby przekształcić je w to
> drugie. Opracowane algorytmy, oparte na teorii optymalnego transportu,
> stosuję do analizy danych pochodzących z eksperymentów obrazowania
> spektrometrycznego.
>
> Do zobaczenia,
>
> Anna Ajduk
>
>
>
>
>
> On Mon, 09 Nov 2020 12:43:08 +0100, Anna Ajduk wrote:
>
> Szanowni Państwo,
>
> Przypominam o seminarium MISDoMP w przyszły czwartek, 19 listopada. O
> swoich badaniach opowie Michał Ciach.
>
> Panie Michale, do przyszłego poniedziałku czekam na tytuł prezentacji i
> 1-2 zdania opisu.
>
> Zgodnie też z Państwa zyczeniem, seminarium odbędzie się tym razem na
> Zoom, poniżej wklejam zaproszenie z linkiem.
>
> Pozdrawiam,
>
> AA
>
> Anna Ajduk is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
>
> Topic: Seminarium MISDoMP
> Time: Nov 19, 2020 05:00 PM Warsaw
>
> Join Zoom Meeting
> https://us02web.zoom.us/j/84689357887?pwd=Vk1PVTVTLytZQTI2MTdta0UxUzVhZz09
>
> Meeting ID: 846 8935 7887
> Passcode: 169037
> One tap mobile
> +48223987356,,84689357887#,,,,,,0#,,169037# Poland
> +48223065342,,84689357887#,,,,,,0#,,169037# Poland
>
> Dial by your location
>         +48 22 398 7356 Poland
>         +48 22 306 5342 Poland
>         +48 22 307 3488 Poland
> Meeting ID: 846 8935 7887
> Passcode: 169037
> Find your local number: https://us02web.zoom.us/u/kcQX79LznW
>
>
>
>
> --
>
> *********************************************************************
> Anna Ajduk, PhD DSc
> Reproductive Biology Group
> Department of Embryology
> Institute of Developmental Biology and Biomedical Sciences
> Faculty of Biology, University of Warsaw
>
> Miecznikowa 1
> 02-096 Warsaw, POLAND
>
> tel. (48 22) 5541212
> fax. (48 22) 5541210
> e-mail: aajduk w biol.uw.edu.pl
> *********************************************************************
>
> --
> *********************************************************************
> Anna Ajduk, PhD DSc
> Reproductive Biology Group
> Department of Embryology
> Institute of Developmental Biology and Biomedical Sciences
> Faculty of Biology, University of Warsaw
>
> Miecznikowa 1
> 02-096 Warsaw, POLAND
>
> tel. (48 22) 5541212
> fax. (48 22) 5541210
> e-mail: aajduk w biol.uw.edu.pl
> *********************************************************************
>
> --
> *********************************************************************
> Anna Ajduk, PhD DSc
> Reproductive Biology Group
> Department of Embryology
> Institute of Developmental Biology and Biomedical Sciences
> Faculty of Biology, University of Warsaw
>
> Miecznikowa 1
> 02-096 Warsaw, POLAND
>
> tel. (48 22) 5541212
> fax. (48 22) 5541210
> e-mail: aajduk w biol.uw.edu.pl
> *********************************************************************
>
> --
> *********************************************************************
> Anna Ajduk, PhD DSc
> Reproductive Biology Group
> Department of Embryology
> Institute of Developmental Biology and Biomedical Sciences
> Faculty of Biology, University of Warsaw
>
> Miecznikowa 1
> 02-096 Warsaw, POLAND
>
> tel. (48 22) 5541212
> fax. (48 22) 5541210
> e-mail: aajduk w biol.uw.edu.pl
> *********************************************************************
>
> _______________________________________________
> Doktoranci-misdomp mailing list
> Doktoranci-misdomp w fuw.edu.pl
> http://tempulin.fuw.edu.pl/mailman/listinfo/doktoranci-misdomp
>

-- 
Ph.D. candidate
College of Inter-Faculty Individual Studies in Mathematics and Natural
Sciences
&  Laboratory of Theory of Biopolymers
University of Warsaw

Pasteura 1, room 144
02-089 Warsaw, Poland
tel: (+48) 22 55 26 364
-------------- następna część ---------
Załącznik HTML został usunięty...
URL:  <http://tempulin.fuw.edu.pl/pipermail/doktoranci-misdomp/attachments/20201218/b361afda/attachment-0001.html>